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简介
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SDS-PAGE 杨兵 主要内容: 一、SDS-PAGE简介 二、实验试剂与器材 三、实验步骤 四、注意事项 一. SDS-PAGE(简介) SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE) : 什么是聚丙烯酰胺凝胶? 加入SDS的作用? SDS-PAGE的用途? SDS-PAGE分离蛋白质的原理? SDS-PAGE的优缺点? 垂直板电泳装置 1.聚丙烯酰胺凝胶 聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺(Acr)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(Bis)在加速剂N,N,N,N—四甲基乙二胺(TEMED)和催化剂过硫酸铵(AP)或核黄素的作用下聚合交联成三维网状结构的凝胶,以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。 蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶电泳时,它的迁移率取决于它所带净电荷以及分子大小和形状等因素。 当向蛋白质溶液中加入足够量SDS,由于十二烷基硫酸根带负电,使各种蛋白质—SDS复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质分子原有的电荷量, 因而掩盖了不同种蛋白质间原有的电荷差别,SDS与蛋白质结合后,还可引起构象改变,蛋白质—SDS复合物形成近似“雪茄烟”形的长椭圆棒,不同蛋白质的SDS复合物的短轴长度都一样,SDS消去了蛋白质电泳时的电荷和分子大小的因素,使蛋白质分子的电泳迁移率主要取决于它的分子量,而与所带电荷和形状无关。 3. SDS-PAGE的用途: 主要用于测定蛋白质分子量。 当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式: logMW=K-bX 式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数。 若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。 4. SDS-PAGE分离蛋白质的原理 分子筛效应:蛋白质分子在SDS-聚丙烯酰胺凝胶中电泳时电泳迁移率主要取决于它的分子量,分子量越小,迁移率越快。 凝胶由分离胶和浓缩胶组成: 上层为浓缩胶,凝胶孔径较大,没有分子筛效应,其pH为6.8,由于快慢离子所形成的高电压梯度,使得变性蛋白质分子在泳动中被压缩为很薄的一层,大大提高了分辨率。 下层为分离胶,凝胶孔径较小,有分子筛效应,pH为8.8,变性蛋白质分子所带负电荷基本一致,泳动速度主要决定于分子量。 5、SDS-PAGE优缺点 优点:设备简单、快速、分辨率和灵敏度高, 特别适用于寡聚蛋白及其亚基的分析鉴定和 分子量的测定 。 缺点:有许多蛋白质是由亚基或两条以上肽链组成的(如血红蛋白、胰凝乳蛋白酶等),他们在变性剂和强还原剂的作用下,解离成亚基或单条肽链。因此,对于这一类的蛋白质,SDS-PAGE测定的只是它们的亚基或单条肽链的分子量,而不是完整蛋白质的分子量。 二.实验试剂与器材 1.试剂: (1) 30%丙烯酰胺 (2) 10%SDS (3)分离胶缓冲液:3.0mol/L Tris-HCl pH 8.8 (4)浓缩胶缓冲液: 0.5mol/L Tris-HCl pH6.8 (5) 10%过硫酸铵(APS)溶液 (6) 四甲基乙二胺(TEMED) (7) 上样缓冲液:Tris-HCl、 SDS、溴酚蓝、甘油、 2-巯基乙醇 (8) 电极缓冲液(Tris-甘氨酸缓冲液) (9) 染色液:甲醇、水 、冰乙酸 、考马斯亮蓝R250 (10) 脱色液:甲醇、水 、冰乙酸 2.实验器材: 垂直板电泳装置 电泳仪 脱色摇床 移液枪 滤纸 大培养皿 垂直板电泳装置 三.实验步骤 1. 安装制胶模具。 2. 分离胶的制备与加入:按规定的比例制备分离胶;将分离胶充分混合后,小心倒入胶模中再在胶面上覆上一层水,水平静置至胶体凝固(室温不同,聚合时间不同)。 3. 倒出水并用滤纸把剩余的水分吸干。 4. 浓缩胶的制备与加入:按规定的比例制备浓缩胶;倒入混合好的浓缩胶,插入梳子(注意避免气泡产生),梳子底部与分离胶的前沿距离约1cm,水平放置直到胶体凝固。 分离胶配制 浓缩胶配制 5. 样品及标准品的准备:标准品按说明书进行处理,供试品 溶液的制备:按各品种项下规定制备。 6. 加样:待浓缩胶溶液聚合后小心拔出样品梳,将电极缓冲 液注满电泳槽前后槽,在供试品孔中加入供试品溶液和标准蛋白质溶液(加样量参照各品种项下规定)。 7. 电泳:垂直板电泳:恒压电泳,初始电压为80V,进入分离胶时调至150~200V,当溴酚蓝迁移至胶底处,停止电泳。 8.剥胶:电泳完成后,关闭电泳仪,拔出电极线。打开盖子,取出电泳模块,打开密封夹,取出玻璃板(凝胶)。将玻璃板取出置于水中,轻轻用撬胶板(绿色)撬开玻璃板,让凝胶滑入水中。 9.染色:用至少五倍体积染色液浸泡凝胶,于平缓摇摆平台上室温1h左右。 10.脱色:用水漂洗数次,再用脱色液脱色,至蛋白质条带 清晰。 四、注意事项 (1)安装电泳槽时要注意均匀用力防止夹坏玻璃板,避免缓冲液渗漏。 (2)虽然应用过硫酸铵/TEMED催化后灌胶15~20 min即可观察到凝胶的形成,但至少需40 min才能保证95%以上的单链聚合成长短以及具有合适的孔径大小。 (3)梳子需一次平稳拔出,否则会破坏加样槽的完整性。 (4)聚胶的最佳温度为23 ~ 25 ℃ ,需要注意灌胶前单体溶液(通常置于4℃冰箱)及玻璃板或管(有时从烘箱取出)也要平衡至此温度。 (5)剥胶时要小心,保持胶完好无损,染色要充分。 (6)聚丙烯酰胺具有神经毒性,操作时要戴手套。
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