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简介
RNA结构分析(FlexNovo)是模拟配体预测和停靠的活动站点上下文中的大片段FlexNovo 是一个简单和容易使用的命令行实用工具,它使您能够轻松地分析结构图案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技术,是一种分子的RNA结构分析实用程序,使您能够查看的片段,演变以及化学配体的理化和几何属性。
它使您能够轻松地分析结构图案和蛋白的 RNA。FlexNovo 基于 FlexX 技术,是一种分子的RNA结构分析实用程序,使您能够查看的片段,演变以及化学配体的理化和几何属性。
1、原始数据产出统计
2、过滤掉低质量reads后的数据统计
3、高级生物信息分析结果报告。
RNA结构分析(FlexNovo)是利用Trinity (Version: r2011-08-20) 进行de novo assembly, Trinity参数:--min_kmer_cov 2 -- min_contig_length 100 --run_butterfly。拼接后的转录本,通过PERL脚本去冗余,在同一个component ID的序列中选择最长的一个isoform代表该locus的转录本,得到Unigene集。
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